Fakultät für Informatik

Thomas Spicher, BSc MSc

Forschungsgruppe Bioinformatics and Computational Biology

Währinger Straße 29
1090 Wien

thomas.spicher(at)univie.ac.at

u:cris-Portal

Lehrveranstaltungen

Sommersemester 2026

053520 VU Algorithmische Bioinformatik

Wintersemester 2025

053530 VU Statistische Methoden der Bioinformatik

Publikationen

Integrating High-Throughput RNA-RNA Interaction Data Into RNA Secondary Structure Prediction. / Skibinski, Denis ; Spicher, Thomas ; Sidl, Leonhard et al.
Bioinformatics Research and Applications - 21st International Symposium, ISBRA 2025, Proceedings. Hrsg. / Jing Tang; Xin Lai; Zhipeng Cai; Wei Peng; Yanjie Wei. Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, 2026. S. 151-162 (Lecture Notes in Computer Science, Band 15757 LNBI).

Veröffentlichungen: Beitrag in Buch › Beitrag in Konferenzband › Peer Reviewed

doi.org/10.1007/978-981-95-0695-8_13

Phylogenetic and Chemical Probing Information as Soft Constraints in RNA Secondary Structure Prediction. / von Löhneysen, Sarah (Korresp. Autor*in); Spicher, Thomas; Varenyk, Yuliia et al.
in: Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology, Band 31, Nr. 6, 01.06.2024, S. 549-563.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

doi.org/10.1089/cmb.2024.0519

Modified RNAs and predictions with the ViennaRNA Package. / Varenyk, Yuliia; Spicher, Thomas ; Hofacker, Ivo L. et al.
in: Bioinformatics, Band 39, Nr. 11, btad696, 01.11.2023.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

doi.org/10.1093/bioinformatics/btad696

Local RNA folding revisited. / Waldl, Maria; Spicher, Thomas ; Lorenz, Ronny et al.
in: Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Band 21, Nr. 4, 2350016, 01.08.2023.

Veröffentlichungen: Beitrag in Fachzeitschrift › Artikel › Peer Reviewed

doi.org/10.1142/S0219720023500166

Vorträge

The impact of post-transcriptional modifications on the tRNA secondary structure"

Spicher, T. (Vortragende*r), Gutenbrunner, K. (Autor*in), Lorenz, R. (Autor*in) & Hofacker, I. (Autor*in)

8 Feb. 2026

Aktivität: Vorträge › Vortrag › Science to Science

Predicting the Effect of RNA Modifications on RNA Structure

Hofacker, I. (Vortragende*r), Spicher, T. (Autor*in), Varenyk, Y. (Autor*in), Lorenz, R. (Autor*in) & Wolfinger, M. T. (Autor*in)

21 Sept. 2025

Aktivität: Vorträge › Vortrag › Science to Science

Positional Impacts on tRNA Structure: Constraint-Based Prediction and Links to Modification Sites

Spicher, T. (Vortragende*r), Varenyk, Y. (Autor*in), Lorenz, R. (Autor*in) & Hofacker, I. (Autor*in)

11 Sept. 2025

Aktivität: Vorträge › Vortrag › Science to Science

Integrating High-Throughput RNA-RNA Interaction Data into RNA Secondary Structure Prediction

Spicher, T. (Vortragende*r), Skibinski, D. (Autor*in), Sidl, L. P. (Autor*in), Holotová, P. (Autor*in), Pan, Y. (Autor*in), Faissner, M. (Autor*in), Velandia-Huerto, C. A. (Autor*in), Lorenz, R. (Autor*in), Waldl, M. (Autor*in), Yao, H.-T. (Autor*in) & Stadler, P. (Autor*in)

3 Aug. 2025

Aktivität: Vorträge › Vortrag › Science to Science