27.11.2020, 14:00 Uhr
Durchführung per Videokonferenz
Titel: „Identification of Gene Regulatory Networks, Potential Prognostic Markers and Drug Targets by WGCNA in Mesothelioma“
Kurzfassung:
Das maligne Pleuramesotheliom ist ein seltener, diffus wachsender Krebs der Pleura (Brustraum). Dieser asbest-assoziierte Tumor zeichnet sich durch Aggressivität, schlechte Prognose und häufige Resistenzen gegen Chemotherapeutika und Strahlentherapie aus. Die therapeutischen Möglichkeiten sind dadurch stark limitiert und die Prognose ist durch die späte Diagnose sehr ungünstig. In dieser Studie wurden folgende Analysen durchgeführt • Eine Stratifizierung der Kohorten in high und low survivors anhand der Expression von CDKN2A, Il-6R, NF2, TERT, TPH1 und YBX1. • Eine Analyse der differentiell exprimierten Gene (DEG) zwischen den Kohortengruppen. • Eine co-expressions Netzwerksanalyse (WGCNA) um Gengruppen (Module) zu finden, die mit dem overall survival korreliert sind. • Die Untersuchung des biologischen Kontextes der differentiell exprimierten Gene und gefunden Module. • Bestimmung potentieller drug targets in den Modulen. Die DEG Analyse hat gezeigt, dass mehrere Matrix Metalloproteinasen, welche in der Umstrukturierung der extra zelluläre Matrix beteiligt sind, hoch reguliert sind. Gene des Immun- und Komplementsystems, und Gene die in der Aktin-Myosin-Aktivität beteiligt sind werden herab reguliert. Die Korrelationsknetwerkanalyse (WGCNA) hat beinahe identische Hubgene in einem negativ korrelierenden Modul mit einer potentiellen Arzneitauglichkeit in beiden Datensätzen gefunden, z.B. BUB1. Stichwörter: Mesothelioma, WGCNA, DEG, hub genes, drug targets