02.08.2022, 11:00 Uhr
Durchführung per Videokonferenz
Titel: „Comparative genome analysis
of photosynthetic flexible Clusia species.“
Kurzfassung:
Ziel dieser Arbeit ist es, eine funktionelle Genom-Annotation zu erstellen und Einblicke
in die photosynthetische Flexibilität und zirkadiane Rhythmik von drei neu sequenzierten
Clusia -Arten zu gewinnen, Clusia multiflora, Clusia minor und Clusia rosea.
Nach derzeitigem Kenntnisstand ist Clusia die einzige bekannte holzige, neotropische
Gattung, deren Mitglieder zu den Photosynthese-Physiotypen C3-, Crassulaceen-
Säurestoffwechsel (CAM)- und C3-CAM-Zwischenformen der Photosynthese fähig sind.
CAM ist eine Anpassung der C3-Photosynthese, bei der die Lichtreaktion (Erzeugung von
NADPH + H+ und ATP) zeitlich von der Dunkelreaktion (Verwendung von NADPH + H+
und ATP zur Fixierung von CO2) getrennt ist. Bei Pflanzen mit dem CAM-Modus werden
die Spaltöffnungen in der Nacht für die Aufnahme von CO2 geöffnet, um Wasserverlust
aufgrund heißer Temperaturen am Tag zu vermeiden. Diese Anpassung an die begrenzte
Verfügbarkeit von CO2 hat sich bei mehreren Blütenpflanzen entwickelt und ist somit ein
Beispiel für konvergente Evolution. Studien, die Sequenz-Daten von eng verwandten C3-,
CAM- und C3-CAM-intermediären photosynthetisierenden Arten analysieren, sind jedoch
noch selten.
Nach der Identifizierung der für den Übergang von der C3- zur CAM-Photosynthese
relevanten Gene aus der Literatur werden Sequenz-Daten integriert, um einen umfassenden
Überblick über die Komplexität der Photosynthesewege in Clusia zu erhalten. Um dies zu
erreichen, werden Workflow-Management-Tools eingesetzt, um eine Bioinformatik-Pipeline
für zukünftige Forschungen zugänglich zu machen.